Publicação
Genomic and Epidemiological Surveillance of Zika Virus in the Amazon Region
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(CGLAB/SVS-MS). Coordenação Geral dos Laboratórios de Saúde Pública. Secretaria de Vigilância em Saúde. Brasília, DF, Brasil. Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Aggeu Magalhães. Recife, PE, Brasil. Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Flavivírus. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Flavivírus. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. University of Birmingham. Institute of Microbiology and Infection. Birmingham, UK. Universidade Federal de Minas Gerais. ICB. Laboratório de Genética Celular e Molecular. Belo Horizonte, MG, Brasil. Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Gonçalo Moniz. Salvador, BA, Brasil. University of KwaZuluNatal. College of Health Sciences. KwaZulu-Natal Research Innovation and Sequencing Platform. Durban, South Africa. Universidade do Estado do Amazonas. Manaus, AM, Brasil. Fundação de Medicina Tropical Doutor Heitor Vieira Dourado. Departamento de Virologia. Manaus, AM, Brasil. 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Laboratório de Ecologia de Doenças Transmissíveis na Amazônia. Manaus, AM, Brasil. University of Oxford. Department of Zoology. Oxford, UK. Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Flavivírus. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Universidade Federal de Minas Gerais. ICB. Laboratório de Genética Celular e Molecular. Belo Horizonte, MG, Brasil. Zika virus (ZIKV) has caused an explosive epidemic linked to severe clinical outcomes in the Americas. As of June 2018, 4,929 ZIKV suspected infections and 46 congenital syndrome cases had been reported in Manaus, Amazonas, Brazil. Although Manaus is a key demographic hub in the Amazon region, little is known about the ZIKV epidemic there, in terms of both transmission and viral genetic diversity. Using portable virus genome sequencing, we generated 59 ZIKV genomes in Manaus. Phylogenetic analyses indicated multiple introductions of ZIKV from northeastern Brazil to Manaus. Spatial genomic analysis of virus movement among six areas in Manaus suggested that populous northern neighborhoods acted as sources of virus transmission to other neighborhoods. Our study revealed how the ZIKV epidemic was ignited and maintained within the largest urban metropolis in the Amazon. These results might contribute to improving the public health response to outbreaks in Brazil. |
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T.Sabino, Ester CerdeiraLoman, NicholasNaveca, Felipe GomesPybus, Oliver G.Alcantara, Luiz CarlosVigilância genômicaVigilância epidemiológicaZika VírusRegião AmazônicaGenomic SurveillanceEpidemiological SurveillanceZika VirusAmazon Regionopen accesshttp://purl.org/coar/access_right/c_abf2https://doi.org/10.1016/j.celrep.2020.01.085DOIGIOVANETTI, Marta et al. Genomic and Epidemiological Surveillance of Zika Virus in the Amazon Region. Cell Reports, v. 30, p. 2275-2283, Feb. 2020.N/AHasVersionhttps://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/40539URLHasVersion2211-1247N/AHasVersion2211-1247N/AHasVersionhttps://doi.org/10.1016/j.celrep.2020.01.085DOI2020-03-27T22:28:57Z2020-03-272020-01-01T00:00:00ZFundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Flavivírus. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Universidade Federal de Minas Gerais. ICB. Laboratório de Genética Celular e Molecular. Belo Horizonte, MG, Brasil.Universidade Federal de Minas Gerais. ICB. 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