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Microbiomas endófitos de plantas suscetíveis a infeção por Xylella fastidiosa
Publicationby Ramos, Rita Vanessa PereiraOrigin: uBibliorumXylella fastidiosa (Xf) é uma das bactérias fitopatogénicas mais perigosas do mundo, sendo responsável por uma vasta gama de doenças com enorme impacto económico e ambiental. O papel central do microbioma associado à planta na manutenção do fitness é crucial, no entanto, pouco se sabe sobre a diversidade e estrutura dessas comunidades de microrganismos endófitos. Atualmente, a procura de alternativas para o controlo e/ou mitigação de doenças das plantas é uma estratégia prioritária para a agricultura sustentável. Desta forma, é essencial estudar a diversidade estrutural da comunidade microbiana endófita e as interações entre endófitos e plantas para elucidar o potencial biotecnológico desses microrganismos. Neste contexto, um dos objetivos deste trabalho foi caracterizar a diversidade estrutural de microrganismos endófitos em espécies de plantas silvestres suscetíveis à infeção por Xf e presentes na zona de foco em Portugal. Desta forma, amostras em que Xf foi detetada e amostras em que Xf não foi detetada foram sequenciadas através da tecnologia ONT. Os resultados da análise da diversidade estrutural das comunidades endófitas mostraram que, de forma geral, as amostras partilham os mesmos géneros nomeadamente, Ralstonia, Caballeronia, Stanieria, Aliterella e Loriellopsis, porém na maioria dos casos não partilham as espécies dominantes. Salienta-se a importância funcional de alguns dos grupos pertencentes ao core microbiome, nomeadamente a capacidade de degradação de substâncias tóxicas, fixação de nitrogénio e promoção do crescimento das plantas. A ausência de sintomas visíveis nestas plantas silvestres, e a ausência de sinais de declínio, podem estar relacionadas com a presença de determinados grupos taxonómicos na comunidade endófita que pela sua função possam promover a modelação da infeção. É também importante salientar que este é o primeiro estudo em plantas silvestres pelo que a identificação destas bactérias pode constituir um ponto de partida para ajudar a compreender o impacto de Xf na disbiose do microbioma. Também é relevante salientar que no microbioma em que a abundância relativa de Xf é maior, passam a ser detetados outros organismos fitopatogénicos, nomeadamente Xanthomonas, permitindo inferir que a sintomatologia e declínio podem ser causados pela ação cumulativa de diversos organismos patogénicos. -
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Desenvolvimento de uma ferramenta molecular para a deteção rápida de Xylella fastidiosa e caracterização nutricional das diferentes variedades de Cydonia oblonga Miller (marmeleiro...
Publicationby Mota, Marlene AbreuOrigin: uBibliorumAtualmente, a Xylella fastidiosa (Xf) é uma das bactérias fitopatogénicas mais perigosas do mundo, sendo responsável por uma vasta gama de doenças com enorme impacto económico e ambiental. Detetada em Portugal em 2019, e com uma crescente área afetada, torna-se fundamental dispormos de ferramentas de diagnóstico rápidas e confiáveis. Neste contexto, um dos objetivos deste trabalho foi desenvolver uma ferramenta para a deteção e identificação rápida de Xf com aplicabilidade em campo. A solução de diagnóstico aqui proposta consiste em acoplar uma deteção preliminar de Xf através da reação Loop-Mediated Isothermal Amplification (LAMP) com a confirmação e identificação molecular através da sequenciação de genes específicos na plataforma MinION MK1C. Esta estratégia reduz o tempo de diagnóstico de semanas para horas, permitindo a adoção de medidas profiláticas em tempo útil, diminuindo o risco de dispersão da bactéria. Estes ensaios serão posteriormente validados de forma a determinar a especificidade e sensibilidade para a deteção de Xf. Adicionalmente, o cultivo do marmeleiro (Cydonia oblonga Miller) tem evoluído na Beira Interior, demonstrando ser um recurso endógeno de grande potencial na região. Desta forma, o outro objetivo deste trabalho consistiu na caracterização nutricional das diferentes cultivares de marmelo cultivadas na região da Beira Interior. As cultivares em estudo demonstraram que os hidratos de carbono foram os macronutrientes em maior abundância, apresentando ainda, teores reduzidos de gordura e um baixo poder calórico. Com a finalidade de diversificar os produtos disponíveis no mercado e valorizar a produção de marmelo, foi desenvolvido neste trabalho um produto inovador, o vinagre de marmelo. -
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Análise faunística de cigarrinhas (Hemiptera: Cicadellidae) na cultura da videira no Rio Grande do Sul.
Publicationby RINGENBERG, R.Other Authors: LOPES, J. R. S.; BOTTON, M.; AZEVEDO-FILHO, W. S. de; CAVICHIOLI, R.Origin: OasisbrIn some American countries, grapevines are affected by Pierce?s disease (PD), which is caused by a particular strain of Xylella fastidiosa not yet reported in Brazil. In order to investigate the potential for PD spread in Brazil in case of pathogen introduction, we conducted a faunistic analysis of leafhoppers (Hemiptera: Cicadellidae) associated to vineyards in the State of Rio Grande do Sul, with emphasis in the subfamily Cicadellinae (sharpshooters), which includes the main potential vectors of X. fastidiosa. Leafhopper samplings were carried out fortnightly during two years (9/2004-9/2006) in four Vitis vinifera vineyards in the municipalities of Bento Gonçalves and Farroupilha (RS). Thirtyfour leafhopper and six spittlebug species were collected, but most (98.4%) of the 3,893 specimens trapped were leafhoppers, distributed in the subfamilies Cicadellinae (60.2%), Gyponinae (34.1%), Deltocephalinae (3.8%) and Coelidinae (0.3%). The sharpshooter specimens were divided in the tribes Cicadellini (68.5%; 12 species) and Proconiini (31.5%; 11 species). Based on the faunistic indices, fi ve species of Cicadellini, Bucephalogonia xanthophis (Berg), Dilobopterus dispar (Germar), Macugonalia cavifrons Stal, Sibovia sagata (Signoret) and Spinagonalia rubrovittata Cavichioli, and three of Proconiini, Molomea consolida (Schöder), Oncometopia facialis (Signoret) and Oncometopia fusca Melichar were prevalent in the vineyards. The high diversity of native sharpshooters in Rio Grande do Sul indicates the existence of a high risk of PD spread if the pathogen is introduced in grapevines.
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