The biometric evaluation is an evaluation method that aims to know the size of the animals from the measurement of several biometric elements. This type of evaluation should be associated with linear evaluation to understand which animals have desirable characteristics related to growth and muscular development. The aim of this study was to perform a biometric evaluation of the backpart of Alentejana cattle portuguese breed; the specific objectives were to perform measurements of various elements of the animal, like thoracic perimeter, body length, width and length of the rump. This work has been carried out so far in several farms affiliated with the breeders association (Associação dos Criadores de Bovinos da Raça Alentejana), based in Herdade da Coutada Real in Assumar, Monforte, between April and June 2017. 134 animals were measured during this period but a wider database was used, with information from 1342 animals from the breeder´s association, with measurements and presenting global reference values: the height at the withers (1,34±0,60m in females and 1,50±0,02m in males), the body length (1,617±0,900m in females and 1,77±0,02m in males), the thoracic perimeter (2,057±0,900m in females and 2,373±0,046m in males), the rump length (0,558±0,430m in females and 0,626±0,009m in males), the outside rump width (0,557±0,004m in females and 0,734±0,059m in males) and the hip-femural width (0,492±0,060m in females and 0,548±0,014m in males). From the results obtained we concluded that there was a positive evolution over the years, related to the animal’s size and conformation and we noticed a great homogeneity between animals, which is justified by values of standard deviation (between 0.030 and 0.207) and coefficient of variation low (between 5.8% and 14%). This type of evaluation is still rarely used by breeder’s associations, but there is expected that their use will help them in the selection and breeding of animals, when associated with other selection methods, like linear evaluation.

Stomach cancer belongs to the most common malignant tumors in Portugal. Main causal factors are age, dietary habits, smoking, and Helicobacter pylori infections. As these factors do not only operate on different time dimensions, such as age, period, or birth cohort, but may also vary along space, it is of utmost interest to model temporal and spatial trends jointly. In this paper, we analyze incidence of stomach cancer in Southern Portugal between 1998 and 2006 for females and males jointly using a spatial multivariate age-period-cohort model. Thus, we avoid age aggregation and allow the exploration of heterogeneous time trends between males and females across age, period, birth cohort, and space. Model estimation is performed within a Bayesian setting assuming (gender specific) smoothing priors. Our results show that the posterior expected rate of stomach cancer is decreasing for all counties in Southern Portugal and that males around 70 have a two times higher risk of getting stomach cancer compared with their female counterparts. We further found that, except for some few counties, the spatial influence is almost constant over time and negligible in the southern counties of Southern Portugal.

Os búfalos do tipo Baio e da raça Carabao encontrados na Ilha de Marajó-Pará/ Brasil constituem duas pequenas populações com número muito reduzido de exemplares, o que os torna extremamente suscetíveis à extinção. De acordo com estudos citogenéticos, estes animais são divididos em dois grupos: os búfalos de rio que apresentam 2n=50, e os búfalos de pântano com 2n=48. O cruzamento entre ambos resulta na formação de híbridos viáveis e férteis com 2n=49, que apresentam na descendência a formação de animais 2n=48, 49 ou 50. Neste estudo foi avaliado um total de 110 animais (45 do tipo Baio, 50 da raça Carabao e 15 descendentes de uma fêmea híbrida), todos pertencentes ao programa brasileiro de conservação dos recursos genéticos. Utilizaram-se técnicas de citogenética clássica e de biologia molecular, para investigar possíveis alterações cromossômicas, a hibridização e aspectos evolutivos entre os búfalos. Para os búfalos do tipo Baio foi observado 2n=50, para a raça Carabao 2n=48, em três exemplares se observou 2n=49 confirmando a ocorrência de hibridização entre os animais do programa. Para alguns descendentes da linhagem híbrida foi observado número diplóide e cariótipo típico de animais da raça Carabao. As análises através de marcadores microssatélites CSSM06, 8, 42, 66 identificaram 13, 14, 6 e dois, o locus Hel9 identificou tres animais respectivamente, como híbridos. Estes resultados foram corroborados com os dados de registro genealógico do programa de conservação. Além disso, caracterizaram-se também as regiões organizadoras do nucléolo- Ag-NORs e FISH 18s, sendo observada uma divergência do número de NORs entre o tipo Baio, presente nos cromossomos 3p, 4p, 6, 21, 23 e 24, e a raça Carabao 4p, 6, 20, 22 e 23, sendo esta resultante da perda do sítio presente no cromossomo 4p ancestral dos búfalos de rio. Para o híbrido F1 foram observados os 11 sítios NORs sendo expressos e em associação, correspondendo as NORs de seus parentais. As análises genéticas realizadas neste trabalho foram implementadas no programa conservação como ferramenta auxiliar para a seleção dos animais. Além disso, estes resultados contribuem com informações sobre aspectos evolutivos entre os búfalos e o fenômeno da hibridização.

Neste trabalho é estudada a viabilidade de uma implementação em paralelo do algoritmo scale invariant feature transform (SIFT) para identificação de íris. Para a implementação do código foi utilizada a arquitetura para computação paralela compute unified device architecture (CUDA) e a linguagem OpenGL shading language (GLSL). O algoritmo foi testado utilizando três bases de dados de olhos e íris, o noisy visible wavelength iris image Database (UBIRIS), Michal-Libor e CASIA. Testes foram feitos para determinar o tempo de processamento para verificação da presença ou não de um indivíduo em um banco de dados, determinar a eficiência dos algoritmos de busca implementados em GLSL e CUDA e buscar valores de calibração que melhoram o posicionamento e a distribuição dos pontos-chave na região de interesse (íris) e a robustez do programa final.

A ação antrópica exerce grande influência sobre ambientes. Diferentes formas de ocupação e uso de um território interferem na paisagem e consequentemente na sua biodiversidade e nos recursos hídricos. O estudo foi conduzido em três Unidades Paisagísticas (UPs), com diferentes níveis de antropismo (alto, médio e baixo) em bacia hidrográfica. O objetivo do estudo foi avaliar a riqueza paisagística, sobretudo a vegetação arbórea em áreas de preservação permanente (APP) e a qualidade dos recursos hídricos em função dos diferentes manejos nestas UPs. Pode-se perceber que satisfação com o trabalho realizado, o amor e o apego ao território são fatores decisivos para que o produtor rural não abandone sua área, independente da extensão explorada. Na UP de alto antropismo verificou-se maior degradação da paisagem, em função da alta pressão de ocupação do território pela atividade leiteira. A biodiversidade da vegetação arbórea em áreas de APP foi menor em áreas de alto antropismo em relação às áreas de médio e baixo. A vegetação arbórea nativa apresenta um crescimento variado entre espécies. A qualidade da água é influenciada pelos diferentes usos da terra e pela topografia nas UPs estudadas. Manejos predeterminam a qualidade da paisagem. A interferência na paisagem e a preservação de APPs dependem da consciência ambiental, mas é determinada também por questões econômicas. Agricultores praticantes de horticultura (de subsistência) e jardinagem são motivados à conservação da vegetação nativa.

Com a finalidade de detectar eventuais alterações cromossômicas, tanto estruturais quanto numéricas, foram analisados citogeneticamente rebanhos de Carabao (swamp buffalo), Murrah e tipo Baio (river buffalo). As amostras sanguíneas do Carabao e tipo Baio foram retiradas de exemplares pertencentes à Embrapa Amazônia Oriental (PA), já as amostras do Murrah são oriundas da Embrapa Clima Temperados (RS). Após a realização da cultura foi feita a análise cromossômica onde o Carabao obteve o menor número (2n=48, XX/XY) enquanto que o tipo Baio e Murrah apresentaram número diplóide igual (2n=50, XX/XY). Na cariotipagem identificou-se a existência de três indivíduos híbridos, que estavam listados como Carabao. Estes apresentaram duas características importantes em seu cariótipo: heteromorfismo do primeiro par e ausência do membro do par 24. Entre a raça Murrah, uma fêmea apresentou heteromorfismo no par sexual (XX). A biometria comprovou a diferença de tamanho do primeiro par cromossômico, no caso do híbrido, e o heteromorfismo do par sexual X do Murrah. Além disso, a biometria cromossômica revelou para o Carabao uma média superior em relação ao tipo Baio e Murrah. O bandeamento G revelou maior quantidade de bandas escuras, ricas em AT, para o tipo Baio enquanto que o Carabao apresentou maior frequência de bandas claras, ricas em CG. A aplicação do bandeamento C revelou marcações semelhantes nas três subespécies, sendo que todos os cromossomos foram marcados nos centrômeros. O tipo Baio apresentou uma marcação distal de heterocromatina constitutiva no cromossomo sexual X. As regiões organizadoras de nucléolo foram identificadas nas regiões teloméricas em cinco pares cromossômicos no Carabao e em seis pares no tipo Baio.

A Classe das Aves abriga uma rica diversidade em todo o mundo com 9.702 espécies, e 1.825 destas estão descritas para o Brasil, mas apesar disso, pouco se sabe sobre a citogenética desse grupo. Uma das ordens com o maior número de espécies de aves, em torno de 5.739, é a ordem Passeriformes, no entanto, apenas cerca de 280 espécies foram até agora cariotipadas. Pipra fasciicauda pertence à família Pipridae, é uma espécie encontrada na região neotropical, são pequenas aves frugívoras de sub-bosque sendo o macho de coloração vistosa (vermelho brilhante, vermelho amarelado e preto) e a fêmea mais discreta (verde oliva). Os objetivos do presente trabalho foram descrever cariotipicamente a espécie Pipra fasciicauda, realizar a biometria dos macrocromossomos, construir o ideograma da espécie e, contribuir para o conhecimento citogenético e taxonômico da família Pipridae e da Ordem Passeriformes. Para obter amostras foi preciso capturar os indivíduos com rede de neblina e o material para análise citogenética foi obtido a partir da técnica de curta duração de medula óssea. Após obter as preparações, fotografaram-se as 10 melhores metáfases para a montagem do cariótipo e sua posterior biometria, e a partir dos valores biométricos construir o primeiro ideograma para essa espécie. O número 2n=78 cromossomos foi observado para a espécie, sendo este constituído por 12 pares de macrocromossomos. A morfologia submetacêntrica foi observada para o 1° par, acrocêntrica para o 2° ao 5° par e telocêntrica para o 6° ao 12° par. O 1° e 3° pares apresentam morfologia conservada em relação ao cariótipo ancestral das aves, o qual possui um grupo de macrocromossomos no qual estão os 1° e 2° pares submetacêntricos e, o 3° acrocêntrico. Os resultados obtidos neste trabalho fornecem um conjunto de caracteres para comparações filogenéticas das espécies da família Pipridae, sendo esta a primeira descrição cariotípica para Pipra fasciicauda.

Although marine turtles have always been observed by divers, there are few scientific works on marine turtles in the Laje de Santos Marine State Park (PEMLS). Diurnal (bimonthly) and nocturnal (biannual) surveys were conducted between 2013 and 2015 for a more comprehensive study, totalizing 42 hours of diurnal observations and the capture of 41 turtles during nocturnal dives. During the diurnal surveys, visual observations were made from two land based sites (Paredão da Face Sul and Portinho). The numbers of heads (heads observed whether they are of the same turtle or not) and turtles (individuals observed in groups) were counted. The results showed the presence of marine turtles throughout the year. More turtles were observed from Paredão da Face Sul than from Portinho, the latter being a more sheltered point and a site preferred by divers. The nocturnal surveys consisted of the capture of turtles through scuba diving so they could be measured and weighed and tagged according to the guide-lines of the TAMAR project. Four nocturnal surveys were conducted and in the last survey three tagged turtles were captured, two of them having been tagged during this study. The measurements of these turtles indicated their growth during the study period.The present survey also highlighted the importance of the PEMLS as a feeding area for juvenile marine turtles.

Prunus campanulata is a species largely adopted for landscape composition in Brazil with limited seedling production by seed dormancy, lacking studies about in vitro propagation. This study aims to evaluate different P. campanulata seed pretreatments on germination, and the effect of GA3 on dormancy break and seedlings biometry. Seeds were processed in three treatments: complete seeds, seeds without endocarp, and isolated zygotic embryos incubated in a WPM medium containing different GA3 concentrations (0.0, 2.0, and 4.0 mg L-1). After 30 days of in vitro incubation were evaluated the germination percentage, mean germination time, percentage of normal seedlings, percentage of seedlings with leaves, and survival percentage were. Seedlings greater than 3.0 cm were selected for ex vitro adaptation, evaluating after 32 days the biometric variables: total length, aerial part length, root length, and the number of leaves. Complete seeds do not germinate, suggesting dormancy associated with the endocarp, whereas seeds without endocarp and isolated zygotic embryos showed the same germination rate, with no effect on GA3. The GA3 promoted greater seedling growth at concentrations between 1.89 mg L-1 for the total length of the isolated zygotic embryo and 2.24 mg L-1 for the length of the aerial part of seeds without endocarp. In conclusion, seed processing, i.e., removing the endocarp or isolating the zygotic embryo can overcome dormancy, improving germination and seedling production of P. campanulata in vitro.

OBJECTIVE: The purpose of this study was to establish longitudinal reference ranges for fetal ultrasound biometry measurements and growth parameters in twin pregnancies. METHOD: A total of 200 uncomplicated twin pregnancies before 21 weeks of gestation were recruited for this prospective, longitudinal study. Women who abandoned follow-up, pregnancies with unknown outcomes or pregnancies with complications were excluded. Ultrasound scans were performed every three weeks, and biparietal and occipitofrontal diameters, head and abdominal circumferences, and femur diaphysis length measurements were obtained for each fetus at each visit. Estimated fetal weight, biparietal/occipitofrontal diameter, head circumference/abdominal circumference, and femur diaphysis length/abdominal circumference ratios were also calculated. Multilevel regression analysis was performed on normalized data. RESULTS: A total of 807 ultrasound examinations were performed in 125 twin pregnancies between 14 and 38 weeks of gestation (6.5±1.4 scans/pregnancy). Regression analysis demonstrated significant correlations for all variables with gestational age, namely log of the biparietal diameter (r = 0.98), log of the occipitofrontal diameter (r = 0.98), log of the head circumference (r = 0.99), log of the abdominal circumference (r = 0.98), square root of the femur length (r = 0.99), log of the estimated fetal weight (r = 0.99), biparietal/occipitofrontal ratio (r = -0.11), head/abdomen circumference ratio (r = -0.56), and log of the femur length/abdominal circumference ratio (r = 0.61). Values corresponding to the 10th, 50th, and 90th percentiles for estimated fetal weight at 28, 32, and 36 weeks, respectively, were as follows: 937, 1,096, 1,284 g; 1,462, 1,720, 2,025 g; and 2,020, 2,399, 2,849 g. CONCLUSION: In twin pregnancies, fetal ultrasound biometry measurements and growth parameters show a significant correlation with gestational age.